Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms