Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme8Q715T0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms