Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynmQ70IV5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynmQ70IV5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms