Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb3Q6XAS4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms