Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc2Q6PDG5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms