Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms