Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms