Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms