Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrcc1Q69ZB0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms