Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Kiaa1549Q68FD9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms