Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CltcQ68FD5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CltcQ68FD5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms