Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ifi47Q61635 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ifi47Q61635 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms