Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd2Q61285 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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