Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms