Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppp1r1bQ60829 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppp1r1bQ60829 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms