Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms