Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms