Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rmi2Q3UPE3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms