Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms