Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms