Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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