Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms