Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VgfQ0VGU4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms