Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms