Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms