Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms