Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MestQ07646 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms