Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms