Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hoxd1Q01822 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hoxd1Q01822 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hoxd1Q01822 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Hoxd1Q01822 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms