Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms