Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama4P97927 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama4P97927 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms