Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms