Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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