Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps29P62274 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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