Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Vbp1P61759 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms