Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P58686 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P58686 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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P58686 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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