Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpdP50404 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpdP50404 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms