Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms