Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx1-2P42580 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms