Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SsbP32067 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SsbP32067 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SsbP32067 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SsbP32067 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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