Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms