Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms