Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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