Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PdgfraP26618 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PdgfraP26618 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PdgfraP26618 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PdgfraP26618 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PdgfraP26618 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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