Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkchP23298 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms