Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P20040 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P20040 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P20040 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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