Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms