Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ifnb1P01575 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ifnb1P01575 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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