Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms