Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Prrt1O35449 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Prrt1O35449 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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