Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Dgcr6O35347 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Dgcr6O35347 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Dgcr6O35347 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Dgcr6O35347 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Dgcr6O35347 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dgcr6O35347 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms